解決資訊保安問題，需要不同的經營者、機構，甚至跨境的相互合作。 HKCERT 與本港的軟件、資訊保安服務和互聯網服務供應商、政府及執法機關協作，收集及發佈情報，統籌應變行動。

HKCERT 亦是 FIRST 及 APCERT（分別是全球和亞太區各個主要 CERT 的協作組織），與其他 CERT 交換情報，及在跨境保安事故上，與其他地區的 CERT 聯繫。